MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 7261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017857	AT	3	6	445942	445947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017857	ATGT	2	8	446006	446013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017857	CTTT	2	8	446064	446071	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_017857	CTA	2	6	446104	446109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017857	TTTC	2	8	446116	446123	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_017857	CAT	2	6	446124	446129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017857	GCT	2	6	446170	446175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017857	AT	3	6	448833	448838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017857	GCT	2	6	449092	449097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017857	CCTCC	2	10	449126	449135	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1011	NC_017857	GCG	2	6	449175	449180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017857	AT	3	6	449309	449314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017857	TTTTA	2	10	449340	449349	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017857	ATGC	2	8	449427	449434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_017857	GTG	2	6	449465	449470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017857	ATT	2	6	456177	456182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017857	AGC	2	6	459688	459693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017857	ATC	2	6	459742	459747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017857	GCG	2	6	461015	461020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017857	CAC	2	6	461105	461110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_017857	AGG	2	6	461117	461122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017857	CAT	2	6	461155	461160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017857	GGT	2	6	461197	461202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017857	TG	3	6	461209	461214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017857	CAGCC	2	10	461227	461236	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1026	NC_017857	AAC	2	6	461356	461361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017857	A	6	6	461429	461434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017857	A	7	7	461519	461525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017857	TCC	2	6	461551	461556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_017857	CAC	2	6	461601	461606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_017857	ACA	2	6	461671	461676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_017857	GAG	2	6	461727	461732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017857	TTAA	2	8	461811	461818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017857	GA	3	6	461832	461837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017857	CT	5	10	461851	461860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_017857	AT	3	6	461875	461880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017857	AT	3	6	461885	461890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017857	TGAT	2	8	463337	463344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017857	CAT	2	6	463350	463355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_017857	GTT	2	6	463356	463361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017857	T	6	6	463380	463385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017857	TAA	2	6	463406	463411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017857	TGA	2	6	463431	463436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017857	GGC	2	6	465062	465067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_017857	T	6	6	465135	465140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017857	TCC	2	6	466846	466851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_017857	ACTTT	2	10	466975	466984	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1048	NC_017857	TCA	2	6	466996	467001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017857	AGG	2	6	467009	467014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017857	T	7	7	467024	467030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017857	GAA	2	6	467044	467049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017857	GAT	2	6	469272	469277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017857	A	6	6	469282	469287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017857	AAT	2	6	469456	469461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017857	CAT	2	6	469471	469476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017857	TAC	2	6	469504	469509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017857	GTG	2	6	469520	469525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017857	TCA	2	6	469527	469532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_017857	TCA	2	6	469677	469682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1062	NC_017857	GTC	2	6	470113	470118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017857	GCT	2	6	470140	470145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_017857	A	7	7	470241	470247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017857	ATT	2	6	470321	470326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017857	GAT	2	6	470354	470359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017857	ATT	2	6	470381	470386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017857	TAC	2	6	470419	470424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1072	NC_017857	ATG	2	6	470727	470732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017857	ATCAA	2	10	470778	470787	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1074	NC_017857	A	8	8	470791	470798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017857	T	6	6	470819	470824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1077	NC_017857	TGAA	2	8	470943	470950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017857	TGCCA	2	10	471137	471146	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1082	NC_017857	ATTAA	2	10	474847	474856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017857	T	7	7	474874	474880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_017857	GACC	2	8	475288	475295	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1098	NC_017857	AT	3	6	475460	475465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017857	TGC	2	6	475497	475502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1102	NC_017857	ATG	2	6	478563	478568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017857	T	6	6	478607	478612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017857	ACG	2	6	478618	478623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017857	ATT	2	6	478638	478643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017857	AAG	2	6	478648	478653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017857	CCGG	2	8	478666	478673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_017857	ACGGT	2	10	478676	478685	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1109	NC_017857	GTA	2	6	480169	480174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1112	NC_017857	AAATG	2	10	481283	481292	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017857	ATG	3	9	481296	481304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017857	CAT	2	6	481355	481360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1116	NC_017857	GTT	2	6	481385	481390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017857	GGA	2	6	481401	481406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017857	TGA	2	6	483377	483382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1120	NC_017857	TGA	2	6	483741	483746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1122	NC_017857	CT	3	6	484023	484028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_017857	AGC	2	6	484067	484072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017857	CAG	2	6	484284	484289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017857	T	6	6	484291	484296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017857	AC	3	6	495870	495875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_017857	CAA	2	6	495944	495949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017857	TCT	2	6	495997	496002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_017857	TGT	2	6	496010	496015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017857	A	6	6	496021	496026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017857	GAG	2	6	496047	496052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017857	TCG	2	6	496086	496091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017857	TGA	2	6	496160	496165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017857	AAC	2	6	496166	496171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1136	NC_017857	GTC	2	6	500463	500468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1412	NC_017857	TGT	2	6	600281	600286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_017857	T	6	6	600286	600291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1430	NC_017857	TGT	2	6	604499	604504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1434	NC_017857	A	6	6	606435	606440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_017857	AT	3	6	606448	606453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1443	NC_017857	TGT	2	6	625583	625588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_017857	TGT	2	6	626516	626521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1446	NC_017857	TGT	2	6	626617	626622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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